En sus primeros años, el OCI colaboró con facultades e institutos de la UNAM, así como organizaciones no gubernamentales y grupos de periodismo de investigación, en la conceptualización, modelado y análisis de redes de corrupción en México con un enfoque basado en datos. Igualmente, contribuyó en la creación de herramientas de derecho comparado y en la elaboración de los primeros borradores de la Política Nacional Anticorrupción.

En la actualidad, las sociedades dan lugar a redes con estructuras frágiles y dinámicas complejas, y los sistemas regulatorios son rebasados por las actividades y la organización de distintos grupos con objetivos criminales, los actos de corrupción se reproducen y entrelazan con otras problemáticas sociales, creando contextos que aseguran y perpetúan la violación de derechos humanos y la impunidad. El OCI considera dentro de sus estudios las distintas manifestaciones de la corrupción y la impunidad en entornos ilícitos, tanto locales como globales, a través de la colaboración institucional internacional.

El OCI conduce investigación científica, tanto fundamental como aplicada, que se publica en revistas especializadas; difunde el conocimiento y fomenta el debate crítico de ideas a través de coloquios y seminarios; promueve la enseñanza a través de diversos cursos, y participa en la formación de profesionales de alto nivel.